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防止黑客程序或恶意代码非法格式化、修改硬盘数据可以将有关的DOS命令改名或移动到其他目录中，以后要格式化硬盘时可以再将文件名改回，具体方法是：找到C：\Windows\format.exe文件，将其文件名改为format.txt或移动至其它目录，如果在“我的电脑”中看不到文件的扩展名，可以选择“工具→文件夹选项→查看”，将其中“隐藏已知文件类型的扩展名”前的钩去掉。另外，还可以使用Windows优化大师来锁住format命令，但基本原理也是将format命令改名另存。
以上方法虽然简单，但有时只能防君子不能防小人。如果别人是从光盘或软盘引导的系统，一样也以格式化硬盘。所以使用以上方法还需要配合BIOS的设置，将计算机的引导顺序设为仅从硬盘引导，并为BIOS加上密码，这样才能万无一失。
方法二：加锁DOS命令法
这种方法的基本原理是将危险的DOS命令加以限制，防止非法使用这些命令对硬盘数据进行破坏。具体方法如下：
用“记事本”打开C盘根目录下的Autoexec文件，并在其中添加如下语句：
C:\>DOSKEY FORMAT=Bad command or filename!
C:\>DOSKEY del=Bad command or filename!
C:\>DOSKEY deltree=Bad command or filename!
然后存盘退出即可。这样再调用FORMAT、DEL、DELTREE等命令时，就会显示Bad command or filename而拒绝操作。如果在某种特殊情况下，你自己需要格式化硬盘，那该怎么办呢?你可以输入命令：C：\>DOSKEY FORMAT= (回车)，这样你就可以自由地对硬盘进行操作了。
